我校校园网站于2009年底改版。新版校园网站不仅在界面上更友好，功能上实现了内外网分离，更重要的是在网站构建上采用了更为可靠安全的新技术。2009年下半年，在教委组织的匿名网站安全检测中，我校旧版本网站，被发现存在着94个各类高、中、低危的安全漏洞。但在教委通报前，新版本校园网站上线后，除极个别外，这些漏洞都已经得到了很好地解决，大大提升了网站的安全系数。
采用新技术构建的新版本校园网站对主流搜索引擎的支持更亲和，更容易被搜索引擎所识别、获取。经过两个多月的运行，校园网站在谷歌、百度等主流搜索引擎中的排名明显上升。目前，在谷歌（Google）上，输入海洋大学关键词，搜索结果上海海洋大学排名第一（未改版前排名第五）；输入海洋关键词，上海海洋大学排在第三，是首页上出现的唯一一所海洋大学。在百度（Baidu）中, 输入海洋大学关键词，搜索结果上海海洋大学排名第二；输入海洋关键词，上海海洋大学是搜索首页上出现的唯一一所海洋大学，充分说明了我校校园网站改版初显成效。